Прижизненное исследование слизистой оболочки желудка имеет большое значение для диагностики различных заболеваний органа. Существует два основных способа получения необходимого материала: аспирационная (слепая) и гастроскопическая (прицельная) биопсия. При аспирационной биопсии кусочки слизистой оболочки получают с помощью специального биопсионного зонда, аспирирующего участок слизистой оболочки желудка, и последующего отсечения аспирированного участка биопсионным ножом. Аспирационная биопсия позволяет более или менее точно диагностировать диффузные изменениия слизистой оболочки (например, хронический гастрит) и не дает почти никакой информации об очаговых поражениях (опухоли). Поэтому в настоящее время она применяется все реже, уступая место» гастроскопической биопсии.

Роль биопсии, осуществляемой при эндоскопическом исследованиии, исключительно важна для распознавания злокачественного характера поражения (например, при обнаружении изъязвления в желудке). При этом никогда не следует ограничиваться однократным получением лишь одного кусочка ткани. С учетом возможности получения ложноотрицательных результатов гастробиопсия должна быть обязательно повторной, с взятием каждый раз не менее 4 — 6 кусочков ткани.

При оценке морфологических изменений слизистой оболочки желудка применяют морфометрический метод, позволяющий установить количественные соотношения клеточных элементов желудочных желез. Для уточнения характера регенерации эпителиальных клеток может использоваться метод гистоавторадиографии, основанный на выявлении ДНК-синтезирующих клеток, меченных [3Н]-тимидином.